Bán được vài đơn hàng trên sàn thương mại điện tử đã bị khấu trừ thuế, nhưng cuối năm mới phát hiện doanh thu của mình chưa đến ngưỡng phải nộp thuế. Vậy số thuế đã bị khấu trừ trước đó sẽ đi đâu? Đây là tình huống mà nhiều người bán hàng online có thể gặp phải khi các sàn thương mại điện tử thực hiện khấu trừ và nộp thuế thay theo Nghị định 117/2025/NĐ-CP.
Điểm đáng chú ý là lần đầu tiên, người bán trên sàn thương mại điện tử có cơ chế đề nghị hoàn lại số thuế đã bị khấu trừ, nộp thay. Không chỉ là thuế thu nhập cá nhân (TNCN), mẫu hồ sơ hoàn thuế ban hành kèm Nghị định 117/2025/NĐ-CP còn thể hiện cả chỉ tiêu về thuế giá trị gia tăng (GTGT). Tuy nhiên, để biết mình có thuộc trường hợp được hoàn thuế hay không, người bán không thể chỉ nhìn vào doanh thu phát sinh trên một sàn.
Cơ quan thuế quản lý theo từng người nộp thuế, không quản lý riêng theo từng nền tảng. Vì vậy, doanh thu từ Shopee, TikTok Shop, Facebook, website riêng hay các kênh bán hàng khác đều cần được cộng lại để xác định tổng doanh thu trong năm.
Ví dụ, một người bán có doanh thu 300 triệu đồng từ Shopee, 250 triệu đồng từ TikTok Shop, 200 triệu đồng từ Facebook và 150 triệu đồng từ website riêng. Tổng doanh thu thực tế trong năm là 900 triệu đồng. Trong khi Shopee và TikTok Shop đã khấu trừ, nộp thuế thay trên phần doanh thu phát sinh tại sàn, tổng doanh thu cả năm của người bán vẫn chưa vượt ngưỡng 1 tỷ đồng. Chính vì vậy, việc tổng hợp doanh thu cuối năm không chỉ để xác định nghĩa vụ thuế phải nộp mà còn giúp người bán nhận diện những trường hợp có thể phát sinh quyền được hoàn thuế.
Khi đó, số thuế GTGT và thuế TNCN đã bị khấu trừ trước đó có thể trở thành khoản thuế nộp thừa và người bán có quyền đề nghị xử lý hoàn thuế theo quy định. Và để thực hiện thủ tục này, người bán nên lưu giữ các báo cáo doanh thu, chứng từ khấu trừ thuế và các tài liệu liên quan để làm căn cứ chứng minh khi cơ quan thuế kiểm tra, đối chiếu. Thủ tục hoàn thuế đối với hộ, cá nhân kinh doanh trên nền tảng thương mại điện tử cũng đã được quy định trong Nghị định 117/2025/NĐ-CP.
Nếu doanh thu đã vượt 1 tỷ đồng mỗi năm, người bán không nên chỉ nhìn vào doanh số bán hàng. Việc tổng hợp đầy đủ doanh thu và chi phí phát sinh sẽ giúp xác định chính xác hiệu quả kinh doanh, đồng thời là cơ sở để thực hiện kê khai và nghĩa vụ thuế theo đúng quy định. Mỗi ngưỡng doanh thu tương ứng với mức thuế suất khác nhau và người bán hàng phải biết để thực hiện theo đúng quy định của pháp luật tránh bị truy thu thuế về sau.
Trong bối cảnh kinh doanh đa kênh ngày càng phổ biến, đây là quyền lợi mà người bán online không nên bỏ qua.
