Theo báo cáo, giai đoạn 2 của Dự án có tổng mức vốn đầu tư 6.399 tỷ đồng, trong đó vốn Nhật Bản (Jica) chiếm 85% và vốn đối ứng trong nước 15%. Giai đoạn 2 có các hạng mục xây dựng mạng lưới thoát nước thải riêng và các trạm bơm ở khu vực Thủ Dầu Một diện tích 1.911ha; xây dựng mạng lưới thoát nước thải riêng và các trạm bơm ở khu vực Thuận An diện tích 3.163 ha; xây dựng nhà máy xử lý nước thải với công suất 17.000 m3/ngày đêm ở TX.Thuận An; mua sắm thiết bị vận hành bảo dưỡng, san lấp mặt bằng, hạ tầng…
Phạm vi của giai đoạn 2 sẽ phục vụ công tác thu gom, xử lý nước thải sinh hoạt khu vực TX.Thuận An và mở rộng mạng lưới thu gom ở các phường nội ô TP.Thủ Dầu Một mà giai đoạn 1 chưa đầu tư. Tổng chiều dài đường cống thu gom của giai đoạn 2 khoảng 350km, có đường kính 100 đến 1.200mm.
Quy mô đầu tư của giai đoạn 2 là xây dựng 9 trạm bơm chuyển bậc và trạm bơm nâng, mạng lưới thu gom cấp 1, 2, 3 và ống áp lực tại Thủ Dầu Một. Xây dựng nhà máy xử lý nước thải công suất 17.000m3/ngày đêm tại P.Vĩnh Phú, TX.Thuận An cùng 10 trạm bơm nâng chuyển bậc, các tuyến ống cấp và ống áp lực.
Khi dự án hoàn thành, sẽ góp phần cải thiện môi trường sống, điều kiện vệ sinh, giảm nguy cơ bệnh tật do nước thải gây ra. Nước bẩn được thu gom từ hộ gia đình, hộ xả thải và dẫn tới nhà máy xử lý, không để chảy tràn lan, hay ngấm xuống đất làm ô nhiễm môi trường, ô nhiễm nguồn nước. Nước thải bẩn được xử lý đến giới hạn cho phép theo tiêu chuẩn Việt Nam trước khi xả ra nguồn nước, bảo đảm không còn các vi khuẩn gây bệnh và hóa chất độc hại khác, tạo môi trường sống an toàn cho con người và sinh vật.
